Naranjas la Valenciana cuenta con las máximas medidas de seguridad en transacciones electrónicas por Internet. Además, el proceso de pago funciona sobre un servidor seguro utilizando el protocolo SSL (Secure Socket Layer). El servidor seguro establece una conexión de modo que la información se transmite cifrada mediante algoritmos de 128 bits, que aseguran que sólo sea inteligible para el ordenador del usuario y el del Sitio Web.
Los certificados de seguridad SSL se muestran en las páginas que disponen de él, con un candado verde que aparece a la izquierda del dominio (en el cuadro superior) cuando el usuario accede a zonas sensibles (procesos de pago,registros...).
Asimismo, naranjaslavalenciana.com manifiesta que no tiene acceso a datos confidenciales relativos al medio de pago utilizado, y por tanto tampoco los almacena. Únicamente "BBVA" y el sistema SERMEPA tienen acceso a estos datos a modo de gestión de los pagos y cobros y que son inaccesibles a otros terceros.